Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3FQ8IUX4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms