Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX29P2Q8IUI4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms