Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms