Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO2Q7Z6W1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO2Q7Z6W1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO2Q7Z6W1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO2Q7Z6W1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMCO2Q7Z6W1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO2Q7Z6W1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms