Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM15Q7Z3B0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM15Q7Z3B0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms