Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms