Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY3Q7L099 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms