Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms