Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PREX2Q70Z35 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PREX2Q70Z35 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms