Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms