Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC149Q6ZUS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC149Q6ZUS6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms