Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCD1Q6ZMY3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms