Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms