Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ZNF638-214ENST00000466975 560 ntTSL 411.35□□□□□ -0.596e-20■■■■■ 39.2
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.962e-10■■■■■ 39.2
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PRPF8Q6P2Q9 PAM-215ENST00000506260 520 ntTSL 32.29□□□□□ -2.042e-10■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 PAM-208ENST00000502472 540 ntTSL 42.29□□□□□ -2.042e-10■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 DLEU1-202ENST00000460525 1031 ntTSL 1 (best)2.07□□□□□ -2.086e-20■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 VPS41-212ENST00000482217 951 ntTSL 51.87□□□□□ -2.111e-7■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 PAM-218ENST00000509636 607 ntTSL 41.84□□□□□ -2.112e-10■■■■■ 39.2
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PRPF8Q6P2Q9 EDEM1-207ENST00000492751 307 ntTSL 51.34□□□□□ -2.192e-10■■■■■ 39.2
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