Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN1Q6NZI2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms