Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms