Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms