Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX8Q68G74 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms