Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms