Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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LRRC38Q5VT99 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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LRRC38Q5VT99 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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LRRC38Q5VT99 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC38Q5VT99 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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LRRC38Q5VT99 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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LRRC38Q5VT99 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC38Q5VT99 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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