Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms