Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms