Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFTN2Q52LD8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RFTN2Q52LD8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms