Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms