Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NBPF1Q3BBV0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms