Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms