Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms