Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC142Q17RM4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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