Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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