Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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