Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SNCBQ16143 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SNCBQ16143 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SNCBQ16143 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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