Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SIX1Q15475 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SIX1Q15475 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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