Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B3Q15393 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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