Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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