Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM2Q15035 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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