Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD4Q14839 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
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