Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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