Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC1AQ14683 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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