Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLINT1Q14677 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLINT1Q14677 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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