Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MDC1Q14676 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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