Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SQLEQ14534 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms