Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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COL9A2Q14055 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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COL9A2Q14055 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A2Q14055 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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