Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNC3Q14003 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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