Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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