Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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