Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR3Q13615 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR3Q13615 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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