Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BFSP2Q13515 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BFSP2Q13515 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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