Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms