Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATMQ13315 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATMQ13315 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATMQ13315 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATMQ13315 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATMQ13315 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ATMQ13315 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATMQ13315 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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