Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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